Vättern försörjer ca 250 000 personer i 11 kommuner med vatten. Sedan 2004 har ett intensivt arbete pågått för att ta fram underlag för en gemensam ansökan om fastställande av ett skyddsområde för Vättern samt södra Bottensjön. Syftet med skyddsföreskrifterna är att säkerställa vattentillgången och vattenkvalitén, med målet att skydda ytvattnet upp till en rimlig och accepterad skyddsnivå.
I detta arbete har åtta kommuner runt Vättern samt Skaraborgsvatten, som förser Skövde, Falköping och Skara med färskvatten och representanter från Vätternvårdsförbundet deltagit. Dessutom har det även funnits en referensgrupp med olika intressenter såsom Försvarsmakten, LRF och Skogsägarna.
Förslaget till föreskrifter och skyddsområde har arbetats fram och godkänts av samtliga huvudmän. Ansökan om fastställande, som ska göras hos varje huvudmans respektive länsstyrelse, är samma för alla huvudmän och ska lämnas in samtidigt. När länsstyrelserna har fått in alla ansökningarna skickas förslaget också ut på remiss till alla berörda markägare.